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昆士蘭大學(xué)BINF6000生物信息學(xué)課程解析

發(fā)布時間: 2023-04-26 07:36:56
文章來源: 考而思
摘要:
BINF6000課程涵蓋我們用于搜索和比較(生物)分子序列(即DNA、RNA和蛋白質(zhì))的原理和技術(shù),以及這些技術(shù)如何幫助我們解決與不同學(xué)科相關(guān)的基本生物學(xué)問題,例如細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)、分子生物學(xué)和進(jìn)化以及醫(yī)學(xué)科學(xué)。

  昆士蘭大學(xué)BINF6000課程為生物信息學(xué)1:簡介,旨在向來自廣泛背景的學(xué)生介紹生物信息學(xué),是一門新興學(xué)科。課程主要向?qū)W生介紹了生物信息學(xué)的理論和實(shí)踐技能,重點(diǎn)是在當(dāng)前技術(shù)的推動下提取和分析數(shù)據(jù)。課程旨在讓學(xué)生掌握與生物科學(xué)相關(guān)的計(jì)算方法和知識技能,包括數(shù)據(jù)庫的使用、常見生物信息學(xué)工具的自動化,以及為分子生物科學(xué)中的代表性問題和數(shù)據(jù)類型開發(fā)量身定制的方法。課程將為學(xué)生學(xué)習(xí)生物信息學(xué)、基因組學(xué)和系統(tǒng)生物學(xué)領(lǐng)域的更高級課程做準(zhǔn)備。

  BINF6000課程涵蓋我們用于搜索和比較(生物)分子序列(即DNA、RNA和蛋白質(zhì))的原理和技術(shù),以及這些技術(shù)如何幫助我們解決與不同學(xué)科相關(guān)的基本生物學(xué)問題,例如細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)、分子生物學(xué)和進(jìn)化以及醫(yī)學(xué)科學(xué)。

BINF6000

  具體而言,BINF6000課程以對分子生物學(xué)的簡要介紹開始,同時涵蓋了:

  (a)分子序列及其影響的比較;

  (b)基因表達(dá)數(shù)據(jù)和全基因組序列的比較分析;

  (c)系統(tǒng)發(fā)育學(xué);

  (d)生物數(shù)據(jù)類型和數(shù)據(jù)庫,以及它們在生物信息學(xué)中的應(yīng)用。

  整個過程中,課程還將培養(yǎng)學(xué)生的計(jì)算思維和技能,以支持大規(guī)模數(shù)據(jù)集的分析(即大數(shù)據(jù)分析)。

  通過課程學(xué)習(xí),學(xué)生將能夠:

  1、獲得生物信息學(xué)的基本能力,包括對分子生物學(xué)和生物化學(xué)的廣泛基本了解,并獲得使用計(jì)算解決科學(xué)問題的實(shí)用技能和分析思維。這包括分別介紹與生物信息學(xué)最相關(guān)的分子生物學(xué)和計(jì)算方面以及計(jì)算機(jī)編程和生物數(shù)據(jù)實(shí)際處理方面的培訓(xùn)。課程還將針對當(dāng)代科學(xué)問題的生物信息學(xué)方法進(jìn)行批判性評估,例如基因組學(xué)和結(jié)構(gòu)生物學(xué)。

  2、了解生物信息學(xué)的范圍——計(jì)算和數(shù)學(xué)思維在生物科學(xué)中的應(yīng)用。作為生物信息學(xué)“用戶”和生物信息學(xué)“開發(fā)者”,都可以進(jìn)行了解。這包括生物信息學(xué)的定義;生物信息學(xué)領(lǐng)域已經(jīng)或?qū)⒁鉀Q哪些類型的問題,哪些類型的數(shù)據(jù)集和技術(shù)已經(jīng)或?qū)⒁鉀Q;用于研究和發(fā)展生物信息學(xué)領(lǐng)域的理論框架和計(jì)算范式。

  3、理解生物信息學(xué)領(lǐng)域的代表性思想——如何利用生物信息學(xué)中的不同思想來解決科學(xué)問題,以及我們可以切實(shí)解決哪些問題。這包括生物信息學(xué)的主題,特別是序列分析、系統(tǒng)發(fā)育學(xué)、基因表達(dá)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)、結(jié)構(gòu)生物信息學(xué)、基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、數(shù)據(jù)庫和本體。

  4、鞏固生物學(xué)基礎(chǔ)知識,以了解一系列生物信息學(xué)問題的性質(zhì)。這包括基本的分子生物學(xué)和生物化學(xué),將生物學(xué)問題、技術(shù)和數(shù)據(jù)置于整體結(jié)構(gòu)中,理解它們之間的關(guān)系以及適當(dāng)?shù)臄?shù)據(jù)結(jié)構(gòu)、算法和計(jì)算要求。旨在將生物序列(DNA、RNA和蛋白質(zhì))、結(jié)構(gòu)、基本化學(xué)和表達(dá)結(jié)合起來。

  5、培養(yǎng)對不同類型生物信息學(xué)問題的認(rèn)識和專業(yè)知識,并認(rèn)識到每個問題的適當(dāng)抽象級別。這包括對適用于手頭問題的生物信息學(xué)類型(例如基因本體分析、序列比對、表達(dá)聚類、基因組注釋、系統(tǒng)發(fā)育分析、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測)的實(shí)際和直觀理解(通常是通過示例)。

  6、識別和描述計(jì)算方法和生物數(shù)據(jù)集的潛力、規(guī)模、范圍和限制。這包括對計(jì)算方法的理論和實(shí)踐觀察的結(jié)合,并考慮到生物數(shù)據(jù)的(通常是組合的)性質(zhì)。這需要了解生物數(shù)據(jù)的規(guī)模和細(xì)節(jié)。

  7、概念化并利用觀察生物學(xué)和計(jì)算方法的迭代設(shè)計(jì)過程作為理解生物學(xué)的有效模型。這包括計(jì)算機(jī)實(shí)驗(yàn)室中使用的實(shí)用方法,生物學(xué)通過數(shù)據(jù)提供計(jì)算方法,以及通過方法提供生物學(xué)見解。

  總的來說,昆士蘭大學(xué)BINF6000課程涵蓋的內(nèi)容非常廣泛,學(xué)生在學(xué)習(xí)過程中難免會遇到無法解決的問題,這時候可以與考而思澳洲課程輔導(dǎo)老師聯(lián)系,老師會為學(xué)生詳細(xì)講解課程內(nèi)容,直至問題全部解決。

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